1979年12月，杭州市医药公司成立（同时挂杭州市医药管理局牌子、实行两块牌子、一套班子）。1980年3月成立杭州市医管局党组和中共杭州市医药公司委员会。1983年9月，撤销杭州市医药管理局，保留杭州市医药公司。1986年8月成立杭州市医药管理局（简称市医管局），撤销杭州市医药公司。1999年9月增挂“杭州市药品监督管理局”牌子。2001年6月撤销杭州市医药管理局。
    杭州市医药管理局隶属于杭州市人民政府领导，为国家行政机关，是统一管理全市医药行业的职能部门。其主要职能是：组织编制本市医药行业的中长期发展规划和市属企业年度计划，抓好企业改革和企业管理工作，组织实施本市医药行业结构和产品结构的调整，组织协调本市重点医药产品的技术攻关、技术协作和市属企业技术改造、基本建设、技术引进、外经外贸项目的可行性技术论证、分级审报，指导与协调全市医药行业的联合和网点设置等。
    1979年至2001年任党组书记、党委书记和局长的有：宋汝镜、董世昌、张先琅、陈大钧。
    该全宗内档案起止时间：1979年至2001年，共有案卷2180卷，排架长度为24米。于2006年接收进馆。
    档案的主要内容如下：
    一、党群工作类：有1980年至2001年局党委会议， 民主生活会议记录、纪要 、决议，党代会及党内重要会议的材料，党委工作计划、总结、制度、责任制，党员名册、年报、党组织关系介绍信、党内人事任免、党组织建立、改选，双评工作、班子建设、党的作风建设；宣传工作计划、总结、精神文明建设，普法材料，计划生育工作；纪检工作计划、总结、汇报材料，党风治理、党纪检查，案件审理、信访工作；工会委员会会议记录、年度工作计划，总结、年报，工会改选、工会干部的任免；团代会材料，团工委会议记录、工作计划、总结、团工委年报、团员名册、共青团组织建立、改选、批复、团干部任免，团员奖惩材料，团刊、团讯；统战工作，人大、政协会议材料；民兵工作；年终评比工作，党群、宣传、计生方面的先进、劳动模范表彰的决定，事迹材料。
    二、行政管理类：有1980年至2001年局办公会议记录、纪要，年终会议材料、行政工作计划、报告、制度、责任制、职责范围，机构调整变更、人事变动；离退休人员的管理、调资、定员编制的报表、干部、职工、大、中专毕业分配的介绍信、报到证，劳动保险、职工培训，违纪职工处理，职称、技师考核的工作材料；新闻报道，医药简报、志史编纂材料；财务审计、核资工作；档案信息工作；房产处理、协议；社会治安工作、责任书；外事活动出访，工作考察、进修的批件材料；劳动、教育、档案信息、新闻报道、治安等方面的先进表彰、事迹材料。
    三、业务管理类：有1980年至2001年生产计划，规划、物资分配；经营管理，任务完成情况，统计报表、普查工作；转制工作；合资经营的报告、请示、批复；产品结构调整和重点产品名单；生产许可证发放，资金管理，产品定价；医疗器械、药品的鉴督和管理；质量创优、标准、计量工作、科研开发、技术改造的计划、方案、报告、批复；产品鉴定材料；设备、能源、环保、安全生产方面的工作计划、报表；经营、统计、企管、质量、科技、设备、环保、安全消防等各类先进表彰、奖励的材料。
    四、基本建设类：有工程项目计划、设计概算书、有关会审材料；项目协议、合同；基建图纸、工程许可证；住户拆迁、安置材料。
    五、会计类：有报表，包括各商业企业汇总报表、行政经费报表、工会行政经费报表；账册：工资册，银行行政经费、预算外银行日记账、现金出纳账、住房租赁保证金、住房基金银行日记账、劳动服务公司银行日记账、行政预算外经费、收支、利润留成明细帐，职工体育银行日记帐、政研会银行日记帐；凭证：各类财务凭证。